Если идет оцилиндрованное бревно, то оно заведомо предполагает наличие трещин в процессе эксплуатации. Сначала дерево досыхает, усаживается фундамент, появляется дополнительная нагрузка после отделки помещения и заезда для ПМЖ. Всё это факторы появления трещин. Чего вы хотите? Это присутствует во всех домах. Если вас эстетически это раздражает - обшейте наружные стены чем-нить. Иначе с заделкой швов - будете потом тратить время на демонтаж старой шпаклевки и затирку новой.