Разрешения на эксгумацию Не дала ни московская прокуратура ни ФСБ (по Бутово). Там раскоп делался "полулегально" - по благословению Патриарха Алексия в 90-е (при самой пристальной фиксации).
Про материалы - в Мемориале нужно побывать лично. По бедности у них не очень удобный сайт.
Из источников - книги памяти. Они есть и в Бутово и в Коммунарке и в Мемориале. Откуда они взялись? В 80-е Мемориал получил доступ (на некоторое время) к 95% (по разным оценкам) дел 1933-1953 годов. И они ВСЕ дела перебрали и большую часть отфотографировали. Оттуда и статистика. По каждому делу есть и номера и реквизиты и решения о реабилитации (в случае наличия таковой).
Все замалчивания, списывание на дезертиров и приуменьшения элементарно "убиваются" личным визитом к ним.

Да, по п.1
37-38 года на Бутовском полигоне сохранились поименные ЕЖЕДНЕВНЫЕ списки расстрелянных. До 300-350 человек В СУТКИ