http://hotel-doma.ru/ - миниотель, вполне нормально.

http://piterflat.ru/ тут квартиру можно снять, без обмана и накладок. Правда для подтверждения брони нужно заранее оплатить первый день. Арендовал там на 3 дня.

ну или вот здесь поищите http://www.komandirovka.ru/hotels/sanktpeterburg/