И в Куско съездить и в Икитос на Амазонке.
Однако, на Амазонку лучше ехать организовав встречу там заранее. Ибо это чревато криминогенными осложнениями. В сети есть проверенные посредники, живущие там. Здесь информацию выкладывать не буду, если захотите - найдете.
Будьте внимательны на границе, количество дней желаемого прибывания Вы указываете сами, однако погранцы могут поставить меньшее количество дней, при обратном вылете могут быть проблемы.
По бюджету - самая дорогая статья расходов это перелет. У Иберии и КЛМ бывают неплохие цены, но дешевле 1000 долларов вряд ли найдете.
Местный транспорт не так дорог.
Думаю, что за 3-5 т.долл можно найти неплохие варианты путешествия.
Лучшее время ноябрь-март. В горах может быть очень холодно в любое время года.